Прототип 2 – вторая версия игры в жанре экшн «Прототип», где геймеру предстоит стать новым персонажем с именем Джеймс Хэллер. Его главная цель состоит в убийстве Алекса Мерсера, главного героя первой части игры. Выполнять задания игрокам предстоит в городе, который поделен на три основные зоны - от менее опасной, где редко можно встретить патрулирующих город, до сущего ада.
Главному герою противостоит довольно сильное сопротивление - со стороны военных города, и со стороны спецотряда Блэквотч. При выполнении заданий особенно полезными навыками выступает умение "ковыряться в мозгах" людей и перенимать все их знания. Умело пользуясь навыком "промывки мозгов", то используя нужного кандидата, можно запросто получить ключи к секретным данным в военной базе и спецотряда Блэквотч.
